Главный герой аниме "Внук мудреца" - Шин, обычный японский парень, чья жизнь круто изменилась после трагической смерти в результате несчастного случая. Возрождаясь в новом мире в виде младенца, Шин сохраняет память о своей предыдущей жизни и становится подопечным таинственного старика, известного как Мудрец. Этот старик становится его наставником и воспитателем, обучая его тайнам мира и магии.

С годами Шин растет и развивается, увлекаясь колдовством. Когда ему исполняется пятнадцать лет, он принимает решение покинуть Мудреца, чтобы продолжить свое обучение в Академии Магии. Мудрец, хоть и беспокоится о психическом состоянии Шина, все же поддерживает его решение и отпускает в мир, полный новых возможностей и испытаний. Таким образом, Шин начинает новую главу своей жизни, полную магии и приключений.

Академия Магии становится для Шина местом, где он может в полной мере раскрыть свой потенциал и научиться управлять магическими силами. Здесь он встречает множество новых друзей и соперников, каждый из которых преследует свои цели и мечты. Шин стремится стать могущественным магом, способным защитить мир от угроз и спасти людей от бедствий. Его путь усыпан трудностями, но он готов преодолеть все препятствия ради своей мечты и новой жизни, которую он начал в этом магическом мире.